醬腌菜腌制過程中發酵溫度不宜過高，盡量保持在12-22℃之間，發酵后，貯藏環境的溫度應大大降低，良好溫度為0℃，空氣對微生物和維生素的影響。為了減少空氣，醬腌菜的容器應該填滿并壓縮，鹽水應該浸沒菜體，并且應該密封。酸洗的衛生條件是防腐的重要因素。酸洗前，一定要把原料洗干凈。除洗滌外，酸洗容器還應消毒，如開水、蒸煮、酒精噴灑和硫磺熏蒸。使用酸洗液，先煮沸，再使用，酸洗處應始終保持清潔。
對于袋裝和瓶裝（玻璃瓶、塑料瓶）的醬腌菜，應使用巴氏法。但溫度不宜過高，時間不宜過長。加熱和后，產品需要在冷水中冷卻，以保持其顏色和脆性。蔬菜原料在儲運過程中受到機械損傷，容易使原色變暗或變褐。因此，在蔬菜的收獲、運輸、加工和貯藏過程中，應防止機械損傷。褐變反應速度與溫度和pH值有關。高溫季節褐變速率比低溫季節快。
溫度一般在100℃以上，時間為10~45分鐘，完成。但是，對醬腌菜的風味和口感影響很大，目前很少使用。溫度的均勻性和后的冷卻環節是過程中的關鍵控制環節。溫度低于100℃,時間一般在幾分鐘到十幾分鐘之間，醬腌菜的口感和風味保存得很好，但仍有一些耐熱微生物殘留，需要結合防腐劑、低溫貯藏等手段，防止其膨脹、發霉等問題。溫度的均勻性和后的冷卻環節是過程中的關鍵控制環節。
醬腌菜的色澤也是感官品質的重要指標。在酸洗過程中保持其自然色澤或改變其顏色是一個重要的問題。腌制蔬菜過程中常發生褐變。褐變會引起顏色變化，使原來的顏色變暗或棕色。由于蔬菜中的多酚和蛋白質在腌制過程中水解為氨基酸，會發生酶褐變和非酶褐變。褐變過程始終貫穿于脆化過程，褐變的腌漬產品呈黃褐色或深褐色。褐變所產生的色澤是一些酥脆食品需要的品質指標之一。
醬腌菜的色澤也是感官品質的重要指標。在酸洗過程中保持其自然色澤或改變其顏色是一個重要的問題。腌制蔬菜過程中常發生褐變。褐變會引起顏色變化，使原來的顏色變暗或棕色。由于蔬菜中的多酚和蛋白質在腌制過程中水解為氨基酸，會發生酶褐變和非酶褐變。褐變過程始終貫穿于脆化過程，褐變的腌漬產品呈黃褐色或深褐色。褐變所產生的色澤是一些酥脆食品需要的品質指標之一。
醬腌菜食鹽消費的基本標準應不超過蔬菜的25％（如100公斤的醬腌菜，大食鹽消費量應不超過25公斤）；鹽的低用量不應少于蔬菜重量的10％（快速腌制蔬菜除外）。腌制果蔬和根莖類蔬菜的食鹽量一般高于腌制葉菜。倒鍋就是把醬汁或醬腌菜在醬腌菜機里上下翻騰。這樣，蔬菜的熱量就可以不斷散發，保持蔬菜原有的色澤。醬腌菜用具要干凈。一般來說，醬腌菜的罐子和罐子要用半年。因此，使用時一定要用刷子把它擦干凈，以除去灰塵和油污。洗過的餐具盡量放在陽光下曬半天，防止細菌繁殖，影響醬腌菜質量。
由于糖在堿性介質中分解很快，很容易參與乙醇胺型褐變反應。因此，控制鹽溶液的pH值在3.5～4.5之間，可以控制褐變率。pH值高，褐變速度快。總之，低溫和低pH能控制褐變率，同時保持新鮮。將醬腌菜浸泡在鹽溶液或氯化鈣溶液中也可以防止褐變，因為氯化物可以控制過氧化物酶的活性。如果產品暴露在氯化物溶液中，酶活性恢復，在空氣中仍會被氧化變色。因此，采取隔氧、控制水分活度、低溫貯藏、避光等措施可以控制褐變。
醬腌菜并不意味著亞硝酸鹽含量會超標，腌制20天后，亞硝酸鹽含量已降至10mg/kg以下，達到正常食用水平。接種乳酸菌的醬腌菜是安全的，因為乳酸菌不會還原硝酸，所以不會產生亞硝酸鹽。而且，就營養和保健價值而言，醬腌菜遠不如新鮮蔬菜值錢。它們只是用來提供礦物質和膳食纖維。過去冬天蔬菜不夠，所以我們嚴重依賴醬腌菜。
對于一種天然發酵蔬菜產品，不如合理使用。首先，要合理制定，確保安全；其次，我們應該限制數量，偶爾吃飯；保證吃醬腌菜不妨礙新鮮蔬菜的攝入，吃醬腌菜時要注意減少食鹽量。我們不應該增加一頓飯的食鹽總量，要控制食鹽總量，加咸食品或調味品，就要相應地少放或不放鹽。這一原理不僅適用于吃醬腌菜，也適用于吃醬油、豆豉、蠔油、醬油、米飯、沙茶等咸味調味品。只要我們堅持這一原則，我們就能享受到這些調味品的美味，獲得鹽中不含的額外營養。
醬腌菜在腌制過程中，由于蔬菜原料質量差、腌制方法不當、環境條件差等原因，會導致蔬菜產品的脆度、色澤差、香氣和口感差。有些腌菜產品受到有害微生物的污染，使產品質量下降、變質、腐爛，還會產生一些有害、有毒物質，因此在腌制過程中，要創造良好的環境條件（如鹵水的濃度，蔬菜鹵水的pH值和環境溫度），促進生化優化，防止變質，腌制成優良產品。
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